装備品の集め方

人によって、かけられるリアルマネーも、育てているキャラも、プレイスタイルも違うので、意見が違うのは当然です。
少し試してみて一番良く装備が集まる方法があなたにとって一番良い方法です。
まだチームレベル90なら、チーム経験値と経験値ポーションとゴールドが非常に欲しいお年頃なので、装備はできるだけレイドで集めたほうがよいでしょう。

塔のアイテムですが、非常にお得だと思います。
50エメラルドのところで3個、100エメラルドのところで7個でますよね。
だって、エネルギー、一番お得な50エメラルドで120エネルギーでも、10回レイドが2回（消費エネルギー6のところ）、あるいは1.5回（消費エネルギー8のところ）、あるいは1.2回（消費エネルギー10のところ）で、3個アイテムでる可能性は低いです。
エネルギー購入はすぐ100エメラルド、150エメラルド、200エメラルドと値上がりしてしまいます。
なので、エネルギー換算すると、欲しいアイテムがあればエメラルド消費しても開けたほうがいいということになりますが、こればかりはお財布と相談です。
私の場合は、ラモルトのカードや錬金術師の一式やエニグマ年代記が莫大にいるので、それが出るときは開けています。
すぐに出なかったら損と思うかもしれませんが、塔のコインも様々な有用アイテムと交換できます（ダンテやオリオンのストーンが買えます）。またゴールドも、ルーレット回すよりお得なので、欲しいアイテムがあって余裕があるなら開けたほうが私はいいと思います。

欲しくないアイテムばかり当たるとおっしゃいますが、このゲーム、今上げている人たち以外も後で必要になってきます。そのとき使いますので安心してください。
私の場合は「オオカミ人間の牙」とか「盗賊ギルドの紋章」イラネ―って思ったけど、今、物理PTとしてダンテやヤスミンをあげていて使ってるので無駄がありません。
緑装備は後で全然必要なくなってくるので、私は、消費エネルギーが少ないところを回るより、自分が欲しいアイテムが出るところを回ったほうが最終的にはお得だと思いますが、これも自由です。
使わない白装備や緑装備も、ギルドポイント稼ぎなどに使えますので、これも無駄になりません。
なのでご自身の考え方次第です。

実はレアフェアが一番エメラルド効率はいいのです。
ただ、おっしゃるように経験値やポーションが足りなくなりますので、ある程度装備をあつめて残りをレアフェアで上げるなど工夫がいります。

ちなみに私はコイン類でストーンもレシピも装備の破片も買いまくりです。
そのとき必要なものを買ったらいいと思います。
ただ、ヒーローのソウルストーンを〇個集める系のクエストありますので、完全に使い切らないで、1000-2000ぐらい（10-20個ぐらい買えるぐらい）常に余分があったほうがよいです。

主さんの育てているチームにもよりますが物理なら砂漠の刃とジャイアントスレイヤー、投げナイフと狼人間の牙が足りなくなるのでこの四つがあるところをメインに回収していけばいいと思います。
魔法系なら牧師の紋章と栄光の手？みたいなやつとエニグマ年代記そしてラモルトのカードがなくなります。
赤装備になると夕刻限やシモンのなんちゃらが本当にすぐになくなるのでキャンペーンで回すとなるときつくなると思います。
タンクが必要とする装備はどうしてもチームに一人のことが多いので上の装備よりは余るので特に事情がなければチームの事情で集めて頂けると幸いです

私なりの考えですが、
・装備品を集めるだけならレアフェアが一番お得
・レベル130まではチュートリアル、レベル上げ重視
・GAとギルドレイドで使用する25人を決めてキャンペーンでもソウルストーンを集める

この3つを前提としてレベル130まではアリーナで使用する5人にソウルストーンと装備品を絞ってひたすらレベルを上げてました。レアフェアは使ってません。
レベル130になってからは1日の活動量（グリフのため、ギルドによってはノルマあり）を決めてソウルストーンを優先、余った活動量でレアフェアに払うエメラルドが少なくなるように装備品を集めています。タワーもショップもフル活用です。
青以下の装備品はいらなくなるので出来るだけ後半のキャンペーンで装備を集めた方がお得だと思います。例外として9-1はオーロラがアブソルートスターになった後でも有効です。
ジェットを育てるつもりならなおさら。
経験値ポーションはレベル130になってしばらくしたら余ります。

僕は紫のめんどい装備（紫＋3で大体来る）の材料はショップで買いましたオレンジの御三家以外はひたすらキャンペーン、タワー攻略で集めました。帰るのはショップで買ってました。（エネルギー半分ほど消費した〜）