FB版でプレイしていますが、ソウルストーン1個あたりの価値はReasonableな範囲だと思います。
おそらく、Raid３で回すと思いますが、ジンジャーのソウルストーンを手に入れるのに、Energyが36もしくは48は必要になると思いますが、（１回が12か16か）どちらも、そんなには悪くないと思います。
Gemを使ってまで実施した方がいいかは、判断が分かれると思いますが、タダのエナジーの範囲内で、目的のItemに近づくと思えば、悪くない選択だと思います。